Содержание:
Это результаты анализов серой неясыти (), сделанные одновременно двумя методами по одному материалу, собранному в один день. Картинки кликабельны.
Первый это ПЦР — как видно результат отрицательный и грамотный ответ «не обнаружено». Второй это бактериологический анализ, которой выявил очень много бактерий и среди них Salmonella sp, которые не обнаружены методом ПЦР. Почему так, лаборатория плохая или это ложноположительный ответ?
Подробная статья о сальмонеллёзе: Сальмонеллез птиц. Признаки. Симптомы. Диагностика. Лечение
Молекулярная и бактериологическая диагностика сальмонеллёза.
Чтобы ответить на эти вопросы начну с объяснения ремарки почему правильно писать «не обнаружено» вместо «отрицательно». Дело в том, что практически любой анализ это статистическая вероятность что-то найти, и она не равна 100%. То есть анализ делается для того, чтобы узнать есть ли что-то в материале или нет. Он не делается для доказательства отсутствия чего-либо в материале. Поэтому, если что-то не нашли это не значит что этого точно нет. Оно может быть даже в этом же самом материале, который исследовали, просто в очень малом количестве, поэтому его сложно найти.
Образно говоря, если вы ловите рыбу в мутной воде крупной сетью, из которой рыба может выбраться, то пустая сеть не доказывает отсутствие рыбы в воде. А вот если рыба попалась в сеть, то она точно в воде была. Поэтому правильно писать — «не обнаружено», и поэтому такой результат исследования не говорит о том, что того, что искали точно нет. Такой результат не может быть и ложноотрицательным, потому что анализ не делался для того, чтобы доказать что чего-то точно нет. Итого, ответ «не обнаружено» говорит: сейчас ничего не нашли, может есть, а может и нет. Поэтому, если есть признаки болезни, а подвердить её наличие никак не получается, при получении отрицательного результата ПЦР этот анализ надо повторять снова и снова. Про такую стратегию и её эффективность я писал вот тут (про анализы на микоплазмоз).
Другая стратегия что-то обнаружить при признаках болезни это делать анализы сразу несколькими способами. Сочетание ПЦР + бактериологический посев для возбудителей инфекций, которые можно культивировать на питательных средах, очень эффективно помогает обнаружить инфекцию. Как в данном случае был обнаружен сальмонеллёз баканализом. То есть теперь точно известно, что сальмонеллы у птицы есть, известна и чувствительность этих сальмонел к антибиотикам.
То есть лаборатория хорошая, сальмонелл всё таки обнаружили (а это довольно редкая ситуация, так как для обнаружения сальмонелл обычно требуется наличие специальных питательных сред, то есть надо заказывать анализ, чтобы делали посев именно на сальмонелл, но в таком случае будут искать только сальмонелл, а всё остальное — что тоже очень важно — не будут искать или, что хуже, не будут учитывать. Это плохая ситуация, когда лаборатория думает за врача и выдаёт что-то типа «условнопатогенной микрофлоры не обнаружено», такой ответ значит: что-то нашли, но сами решили важно это или нет.
Может ли такой ответ быть ложноположительным — теоретически да, если лаборатория ошиблась и приняла другую бактерию за сальмонелл. Вероятность такой ситуации не нулевая, так как ПЦР не дало ответа. А специфичность бактериологического метода определения сальмонелл примерно 95%. В таком случае правильно запросить у лаборатории подтверждение выделенных бактерий методом ПЦР. Тогда будет дополнительное подтверждение того что это точно сальмонеллы. Это стоит как отдельный ПЦР анализ, делается в течение дня (вообще-то это делается примерно за час, но ради одного анализа не станут запускать анализатор). А потом уже можно озадачиться определением какая именно это сальмонелла и запросить секверирование (если лаборатория его делает). Определение сальмонелл до вида важно, например, чтобы понять степень опасности для человека.
Но возвращаясь к случаю с этой совой достаю «рояль в кустах»: она была не одна, а целый выводок из трёх совят, который живет вместе и их всех кормили курятиной (об этом ниже). И у согнёздника сальмонеллы были обнаружены методом ПЦР.
А у третьей совы сольмонеллы не обнаружены никак, ни методом ПЦР, ни методом бактериологического посева.
Итого:
— точно известно, что в группе птиц сальмонеллы, потому что метод ПЦР обладает специфичностью в 99.99%, (то есть вероятность ошибки чрезвычайно мала).
— наглядно видна эффективность сочетания ПЦР+бактериологический анализ и наглядно видно, что повторение ПЦР анализа повышает вероятность обнаружить то, что ищется.
— получена информация о наличии возбудителя инфекции и о его чувствительности к антибиотикам.
Внимание !!! Информация о чувствительности обнаруженных сальмонелл в этом результате антибиотикочувствительности актуальна только для этой конкретной ситуации. Нельзя применять антибиотики эффективные в этом случае для лечения других птиц. Антибиотики назначаются индивидуально на основании подобных исследований. Если вы будете лечить птиц по чужим анализам, то вы будете увеличивать количество устойчивых к антибиотикам бактерий, создавать опасность для самих себя и своих близких.
Кроме этого, есть второй «рояль в кустах»: у всех трёх сов сходные деформации позвночника и пневмония. Это признаки детского рахита и развития системных инфекций (то есть поражающих все органы птицы). То есть ещё одно подтвержение наличия общей инфекции.
Можно ли давать совятам куринное мясо?
И третий «рояль»: всех трёх совят кормили сырой курятиной, пока они не попали в правильные руки. А курятина очень часто заражена сальмонеллами (конечно в магазинах и на рынках её должны проверять на сальмонеллёз, но посмотрите в любом поисковике как часто появляются новости «в столовой/ресторане/детском лагере произошло массовое отравление и выявлен сальмонеллёз»). То есть известен общий для этих совят очень вероятный источник сальмонелл, которые очень устойчивы к антибиотикам. А устойчивы к антибиотикам они потому что кто-то уже применял антибиотики для лечения кур и посмотрите сколько в фермерских пабликах советов как лечить кур — «надо пропоить их 2-3 дня тем-то и тем-то». Вот так и выводят полирезистентных сальмонелл, а это опасно не только для сов, но и для тех, кто их накормил курятиной, и для тех, кто в конечном итоге решил обследовать совят.
Достаточно один раз накормить совёнка сырой курицей, чтобы развилась деформация активно растущих костей, потому что совёнок должен получать не только белок, но и кальций и прочие компоненты, которых в курятине почти нет. Поэтому же не надо кормить взрослых сов и дневных хищных птиц цыплятами — да, это дешево, но это плохой корм, который часто еще и заражен инфекциями птиц опасными для человека.
Подробная статья о том как кормить взрослых сов: Чем кормить сову, сипуху, неясыть, филина, сычика .
Инфекции птиц развиваются как комплексное заболевание.
Остальные бактерии обнаруженные в стае: Clostridium sp. Enterobacter cloacae, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Proteus mirabilis, Staphylococcus cohnii, Staphylococcus gallinarum — это сопутствующие инфекции, каждая из них не менее опасна, чем сальмонеллёз; поэтому лечение надо подбирать такое, чтобы препараты максимально перекрывали чувствительность выделенных патогенов. Но этот комплекс инфекций называется сальмонеллёзом потому, что сальмонеллы самые патогенные среди этих бактерий.
Более того, у всех трёх неясытей на рентгене есть признаки развития хронической пневмонии и наличие гранулём в лёгких и воздушных мешках — такие изменения чаще всего развиваются при аспергиллёзе, несмотря на то, что в первых анализах аспергиллы не выявлены ни у кого из этих трёх сов. После проведения лечения от обнаруженных инфекций, надо будет снова повторять анализы и рентген, и если на рентгене будут оставаться очаги воспаления, то надо будет проводить лечение от респираторного микоза. А может быть повезёт и аспергиллы будут выявлены повторными анализами и удастся получить их чувствительность к препаратам.
Почему совята не погибли, надо ли вообще лечить, вдруг это не опасная болезнь.
Совята не погибли в раннем возрасте, а дожили до осени потому, что летальность сальмонеллёза не 100%. После того, как прошла острая стадия заболевания во время которой погибает большинство заражённых птиц, сальмонеллёз переходит в хроническую форму — как это и случилось в этой стайке. Хронический сальмонеллёз может протекать годами, такие птицы малоактивны и в природе они быстро погибают от голода, попадают под машины (не встречал здоровых птиц сбитых машинами), или кто-то их съедает. Эта ситуация также является хорошим примером того, что больные птицы могут жить очень долго, и признаки болезней у них не заметны для владельцев. Если таких птиц не лечить — то они погибнут от вторичных инфекций. Кроме того, совята попали в хорошие руки и хотя не было лечения, было правильное кормление и содержание.
Подробная статья: Чем кормить совёнка ушастой и болотной совы, неясыти, сипухи, филина, сыча, сплюшки, совки.
Также этот пример показывает насколько легко принести в реабилитационный центр инфекцию, если нет карантина и обследования прибывших птиц. Хронически больные птицы выделяют возбудителей инфекций в окружающю среду, и все птицы у которых еще нет иммунитета зажаются. Кто-то выживет, но большая часть птиц погибнет.
Подробная статья: Лечение сов. Инфекционные, паразитарные и не заразные болезни.